Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ZNF239Q16600 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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ZNF239Q16600 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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ZNF239Q16600 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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