Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC18A3Q16572 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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