Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CNGA3Q16281 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNGA3Q16281 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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