Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TAF1AQ15573 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TAF1AQ15573 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TAF1AQ15573 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TAF1AQ15573 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TAF1AQ15573 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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TAF1AQ15573 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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TAF1AQ15573 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TAF1AQ15573 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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