Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CDSNQ15517 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CDSNQ15517 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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