Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NCAPHQ15003 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms