Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SMC1AQ14683 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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