Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PDE3AQ14432 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms