Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MTMR3Q13615 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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MTMR3Q13615 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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MTMR3Q13615 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MTMR3Q13615 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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