Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPRL3Q12980 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms