Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PTP4A2Q12974 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PTP4A2Q12974 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTP4A2Q12974 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTP4A2Q12974 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PTP4A2Q12974 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTP4A2Q12974 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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