Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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FOXC1Q12948 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
FOXC1Q12948 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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