Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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