Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GOLGA3Q08378 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms