Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DEUP1Q05D60 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DEUP1Q05D60 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms