Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PTPN12Q05209 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms