Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKOR1P84550 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKOR1P84550 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms