Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SSBP2P81877 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms