Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ERVPABLB-1P60509 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVPABLB-1P60509 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms