Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPFP49454 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPFP49454 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms