Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RANGAP1P46060 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANGAP1P46060 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms