Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
OTX2P32243 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
OTX2P32243 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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OTX2P32243 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
OTX2P32243 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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