Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRKCHP24723 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRKCHP24723 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRKCHP24723 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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PRKCHP24723 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PRKCHP24723 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PRKCHP24723 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PRKCHP24723 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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