Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP4AP20648 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP4AP20648 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms