Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGA4P13612 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms