Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 FAM153C-213ENST00000620373 1048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OXA1L-213ENST00000612549 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PADI4-202ENST00000375453 841 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TIMD4-202ENST00000406964 581 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 LINC01280-201ENST00000449783 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 OR4A50P-201ENST00000526321 908 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 RBFOX2-203ENST00000397303 1354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATXN8OSP0DMR3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 AC092119.2-201ENST00000616774 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATXN8OSP0DMR3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms