Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM228BP0C875 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM228BP0C875 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms