Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
IFNB1P01574 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
IFNB1P01574 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IFNB1P01574 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms