Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 MACROD2-204ENST00000407045 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPRTO14522 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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