Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms