Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HMGB1P1B2RPK0 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms