Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARID3CA6NKF2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms