Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MAP3K4Q9Y6R4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MAP3K4Q9Y6R4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MAP3K4Q9Y6R4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms