Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN6Q9Y6Q1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN6Q9Y6Q1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms