Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAD1L1Q9Y6D9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms