Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF2Q9Y5W3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLF2Q9Y5W3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms