Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC1Q9Y5R8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms