Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAI2Q9Y5P3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAI2Q9Y5P3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAI2Q9Y5P3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms