Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RAPGEF2Q9Y4G8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
RAPGEF2Q9Y4G8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.19■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
RAPGEF2Q9Y4G8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms