Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP15Q9Y4E8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
USP15Q9Y4E8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USP15Q9Y4E8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms