Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSX2IPQ9Y2D8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms