Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NCKAP1Q9Y2A7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NCKAP1Q9Y2A7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCKAP1Q9Y2A7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms