Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BTRCQ9Y297 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BTRCQ9Y297 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms