Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAF3IP3Q9Y228 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAF3IP3Q9Y228 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms