Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERVW-1Q9UQF0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERVW-1Q9UQF0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms