Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLCA2Q9UQC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLCA2Q9UQC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms