Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SHANK2Q9UPX8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SHANK2Q9UPX8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SHANK2Q9UPX8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms