Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP22Q9UPT9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP22Q9UPT9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms