Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM33Q9UPN9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms