Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTF2Q9UNY4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTF2Q9UNY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTF2Q9UNY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms